根据的认定，夫妻分居的条件包括：夫妻不在一处居住、不履行夫妻权利、不过夫妻性生活，分居原因是因为感情不和，并且分居已连续满两年。只有在这种情况下，才会对这段婚姻关系做出判决。
法律分析
不一定。认定夫妻分居的条件有三个：
（1）夫妻分居，包括因感情不和而导致的不在一处居住，不履行夫妻之前的权利、不过夫妻性生活。
（2）分居的原因是因感情不和。
（3）分居连续已满两年。
综上所述，如果是因为感情不合所以才导致分居两年的，才会对这段婚姻关系进行判决。
拓展延伸
分居两年后是否可以自动解除婚姻关系？
根据中国婚姻法的规定，分居两年后并不会自动解除婚姻关系。尽管分居时间较长，但仍需通过法律程序来解除婚姻。根据具体情况，您可以选择提起离婚诉讼或协议离婚，然后经过的审理和判决，才能最终解除婚姻关系。因此，分居两年后并不意味着婚姻自动解除，仍需依法办理离婚手续。建议您咨询专业律师以获得准确的法律意见，并根据个人情况进行相应的法律行动。
结语
综上所述，根据中国婚姻法的规定，分居两年后并不会自动解除婚姻关系。尽管分居时间较长，但仍需通过法律程序来解除婚姻。建议您咨询专业律师以获得准确的法律意见，并根据个人情况进行相应的法律行动。
法律依据
根据《民法典》第1079条规定：人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：因感情不和分居满二年。