1、编制性质上不同：事业单位行政编制，档案在人事组织部存放。事业单位的老职工是事业编制，档案在人事局或人事科存放。
2、含义上的不同：人事代理是指人事代理是指由人事部门所属的人才服务中心，按照国家有关人事有哪些法规要求，接受单位或个人委托，在其服务项目范围内为多种所有制经济全方位服务。正式编制通常是指在组织机构的设置及其人员数量的定额和职务的分配。
3、工作稳定性上的不同：事业单位自己招聘的人员（即：没有通过人事部分、与单位主管部分的批准）无编制，虽然也与单位签订合同，但仅仅充其量也就是劳动合同而已，随时会被解聘。但是正式编制是非常稳定的，除非出现非常严重的错误才会被开除。