1、农户之间发生宅基地权属争议时，双方都应该相互尊重、互相谦让，一同协商处理问题。
双方协商一致成功后，最好签订一份协议，这样双方达成的协议不可以有违反相关的法律法规，也不可以损害国家集体利益跟其他村民的合法权益。
2、协商失败的，当事人任意一方或者双方都可到当地乡(镇)或者土地管理所等受理机关提出处理申请。
3、假如乡镇没有受理，当事人和双方都可直接向县或者国土局进行申请，如若条件符合受理，可指定受理或者是直接受理。受理机关对受理的宅基地权属争议，如先行调解无效的，应当作出处理决定。
4、当事人对处理决定有异议的，在收到处理决定通知之日起15日时间里向上级处理机关申请复议，接到处理决定后也可以在30日内直接向人民起诉。接到复议申请的上一级处理机关以后，给出复议决定时间一般都是在3个月之内。如果当事人对复议决定有异议的，可以在接到复议决定通知之日起15日之内向人民起诉。在处理宅基地权争议时间里，任何一方都不能对宅基地现状跟破坏其房屋。
【本文关联的相关法律依据】
《土地管理法》第六十二条，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。
人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级在充分尊重农村村愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。
农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。
编制乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。
农村村民住宅用地，由乡（镇）审核批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。
农村村民出卖、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地；
鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。
农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。